Fasilitas yang dimiliki SMP 3 Pajangan antara lain ruang kelas sejumlah 12 ruang yang dilengkapi LCD, laboratorium komputer (2ruang) terdiri dari 34 unit komputer dengan spesifikasi Dual core dengan OSwindows, laboratorium IPA, Perpustakaan Umum dan perpustakaan mushalla, Musholla yang representatif, dan lapangan olah raga yang memadai.