Ekstrakurikuler karawitan adalah kegiatan di luar jam pelajaran sekolah yang mengajarkan dan melatih siswa dalam seni musik tradisional Indonesia, khususnya gamelan. Karawitan merupakan kesenian yang dibawakan secara berkelompok, sehingga siswa harus dapat saling bekerja sama. SMP N 3 Pajangan melaksanakan kegiatan Ekstrakurikuler karawitan setiap hari Kamis jam 14.30 di ruang karawitan SMP N 3 Pajangan. Ekstrakurikuler karawitan memiliki beberapa tujuan, di antaranya: 

• Mengembangkan bakat, minat, dan kreativitas siswa di bidang seni tradisional 
• Mengenalkan dan memberikan gambaran awal kepada siswa tentang kesenian tradisional dalam budaya Jawa 
• Membentuk karakter siswa melalui nilai-nilai kebersamaan, disiplin, dan rasa tanggung jawab 
• Mendalami aspek-aspek budaya Indonesia dan memahami peran seni dalam membentuk identitas nasional 
• Menjaga dan melestarikan tradisi musik Indonesia